専門分野；バイオテクノロジー
研究課題； OMICS新技術開発と応用

1.主要な研究の概要


生物を研究し生物機能を高度に利用するためには、ゲノム・RNA・ペプチド・タンパク質・糖鎖・代謝産物などの網羅的同定とそのネットワーク構造の理解が不可欠です。これら研究や開発を行う際には新規なアイデアが必要な事は言うまでもありませんが、アイデアを具現化し実施するための装置・機器が不可欠な時代となってきています。特にポストゲノム科学として種々のOMICS研究を推進する上では各種質量分析装置等の高性能機器群を開発し、さらに使いこなす必要性が増してきています。
現在、本研究室にはMALDIタイプの質量分析装置とLCMS-IT-TOF型の質量分析装置を設置し、質量分析技術の改良・応用を行なっています。また、材料として植物・微生物を供給できるシステムを構築いたしました。これらの材料を用いて、更には、センター内研究者との共同研究を推進し各種サンプルを網羅的に解析します。解析結果をセンターが持っている理論的な側面と融合させることで、物質生産に寄与する知見を見出すことが出来るとともに産業化への発展を目指していく考えです。
また、共同研究先の研究者・学生と共に分析を行うことにより、広く技術を社会に還元すると同時に、装置群を使用する過程で明らかになってくる問題点等を機器メーカとの共同研究により解決していき、より効率的な新規技術を開発したいと考えています。


 OMICS新技術開発と応用


主要な研究論文、著書


１） Chieko Sugita,  Koretsugu Ogata,  Masamitsu Shikata, Hiroyuki Jikuya,  Jun Takano, Miho Furumichi, Minoru Kanehisa, Tatsuo Omata, Masahiro Sugiura, Mamoru Sugita / Complete nucleotide sequence of the freshwater unicellular cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC6301 chromosome: its gene content and organization /　Photosynthesis Research / in press
２） Ou K, Kesuma D, Ganesan K, Yu K, Soon SY, Lee SY, Goh XP, Hooi M, Chen W, Jikuya H, Ichikawa T, Kuyama H, Matsuo E, Nishimura O, Tan P. / Quantitative Profiling of Drug-Associated Proteomic Alterations by Combined 2-Nitrobenzenesulfenyl Chloride (NBS) Isotope Labeling and 2DE/MS Identification / 2006 / Journal of Proteome Research / 5(9) / 2194-2206.
３） Joseph T, Lee TL, Ning C, Nishiuchi Y, Kimura T, Jikuya H, Ou K, Chin YC, Tachibana S. / Identification of mature nocistatin and nociceptin in human brain and cerebrospinal fluid by mass spectrometry combined with affinity chromatography  and HPLC / 2006 / Peptides / 27(1) / 122-130
４） Ou K, Ong C, Koh SY, Rodrigues F, Sim SH, Wong D, Ooi CH, Ng KC,　Jikuya H, Yau CC, Soon SY, Kesuma D, Lee MA, Tan P. / Integrative genomic, transcriptional, and proteomic diversity in　natural isolates of the human pathogen Burkholderia pseudomallei.  / 2005 / Journal of Bacteriology / 187(12) / 4276-4285　


主要な研究手法、技術


質量分析技術を核とした、プロテオミクス（二次元電気泳動・LCを分離手段として使用）、メタボロミクス（LCMS-ITTOFを使用）による生体物質のプロファイル作成と化合物同定・構造解析